
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱海洋生物 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研究分析没想到
来探寻职工来探寻随之保温事件不断不断增加牛羊肉的密度、持水、色彩、解离铁纯度、ROS、脂质过钝化物、MDA、GSH和GPX4平均水平来考核身体肌肉组织开展癌生殖细胞的铁自杀模式。結果显现,保温事件不断不断增加后,牛羊肉的密度在第5天和第6天相关系数下调;持水能力素质拉低;色调变深,逐渐耗尽凹凸感,鲜黄色化为暗黄色。再者,解离铁、活力氧和MDA的纯度相关系数不断增加,癌生殖细胞凋亡率相关系数身高。 设计者转化成差距冷冻冷藏时候的腿部肩部肌肉供试品的血清酶质,如果完成SDS-PAGE研究,血清酶质条带在差距阶段遍布均衡且类似于(图1a)。据血清酶在差距供试品中的体现症状,研究找到统一个组供试品的中五位数说出于统一个总体水平(图1b),阐明腿部肩部肌肉供试品血清酶质都具有保持良好的组内类似于性和组间差距性。 膳食纤维质组学共检验出1996种膳食纤维质。以B0为照表组,需求B1、B2、B4和B6中的膳食纤维完成其他之处表明定量概述,共检验到37九个DEPs。将火山图交互,并按照其FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.055个标准的定量概述DEP。结杲如图下图1c-f下图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别检验出22、33、73和140个DEPs,其中的分发型别调整6、11、32和8九个,下跌16、22、41和5两个。聚类算法方式估评了其他冷库环节腿部肌肉组织结构组织结构中膳食纤维质的表明,结杲提示 腿部肌肉组织结构膳食纤维表明其他之处发生变化存贮事件的增大而增大(图1g)。
图1| 不一样要在冷藏室保存精力的腹肌样品英文蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有所的差异保鲜精力的力量样本的差异淀粉酶概述(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁致死血清肽的PRM酶联免疫法阐述(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 通过KEGG含有一定的差异表现球蛋白的铁身亡系统(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物制品提供了TMT降钙素原检测脂肪酸质组学技能设备服务性保障,拜谱生物制品已产品的研发达成并建设了改进早熟的转录组学、脂肪酸组学、消化吸收组学甚至多个学协同产品的技能设备服务性保障组织体制,欢迎致电咨询!
参看医学文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.