
2024年9月由上海农林牧师范大学张万刚老师创业团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱海洋生物为该研究提供了亚硝基化掩盖组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
常常文章标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
杂志期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202历经四年影响到系数:5.7
刊登日期:2024年9月
买家机构:南京农业大学
的研究村料:蛋白
拜谱带来了技术性:亚硝基化修饰组学
科技交通路线:
一、探索报告
01.Caspase-3可溶性
如今尚不明了NO对caspase-3的能够抑做用有无归因于NO介导的S-亚硝基化,其他有机废气浓度均值的GSNO用于外源性NO生产,以诱骗caspase-3的休外S-亚硝基化。的结果证实,与是没有GSNO的组比起,100、200和400μM GSNO组的caspase-3活力性有效减低(图1),与已经新闻稿高度。GSNO清理减低caspase-3活力性的潜在的原因分析仍亟需表明。
图1 各不相同密度的GSNO进行处理对caspase-3活性氧的影晌
02.Caspase-3的S-亚硝基化情况
调查方案Caspase-3的亚硝基化方面,以系统阐述GSNO对Caspase-3的反應性。经GSNO加工处理后,探测到caspase-3球蛋白S-亚硝基化效果新增(图2)。许多结论阐明,外源性GSNO培养出来可成功的 引导caspase-3的休外S-亚硝基化。最令 吃惊的是,在不会有GSNO会有的较组中探测到一些衰弱的S-亚硝基化带,这阐明caspase-3有可能的发生内源性的S-亚硝基化。因此,本调查方案中caspase-3的S-亚硝基化方面较高,而caspase-3的灵活性变低,这与先前的调查方案一致性。所以,caspase-3的特女性朋友S-亚硝基化绘制位点尚不模糊,还必须进一歩的探求。
图2 GSNO除理对caspase-3S-亚硝基化的水平的直接影响
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化修饰语组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的回文回文序列。白色标出的回文回文序列代表S-亚硝基化肽,颜色标出的C代表S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱分析
04.S-亚硝基化Caspase-3降解塑料结淀粉酶
结核血清质看做这种核心的组织骨架核血清质,在稳定肌组织的结构类型的的结构类型完好篇详细性和抽缩性个方面起着核心的功效,研究探讨S-亚硝基化caspase-3对结核血清质化学可降解的明各样有着核心意义上。与Std(未用胱天核血清质酶-3和GSNO孵育的初期肌氯纶核血清质)组不同于,0 μM GSNO组(肌原氯纶和caspase-3的孵育,无GSNO)的完好篇详细结核血清质含氧量可观大大减少,信息提示caspase-3对结核血清质有着隐性的核血清质蛋清质水解效率。在GSNO孵育后,完好篇详细结核血清质的含氧量明星提高(P < 0.05)。不仅如此,当GSNO溶度上升时,完好篇详细结核血清质的含氧量快速调涨(P < 0.05)(图5)。此种出现阐明,SNO修饰语的caspase-3以含量依赖感的的方法限制结核血清质的化学可降解。
图5.S-亚硝基化caspase-3吸附结蛋清
05.S-亚硝基化Caspase- 3分解肌钙蛋白酶-T
肌钙球核血清质-T (TnT)是原肌球球核血清质调整担任肌群伸缩的丝条的一定要肌原纤维棉素素球核血清质。TnT的可分解特色是测试到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化的条件下,caspase-3对TnT的可分解环境图甲6下图,与Std组(不包括caspase-3和GSNO的肌原纤维棉素素)不同于,caspase-3组中30 kDa TnT场面描写相关系数加剧,表达caspase-3参与的了TnT的可分解,显然,caspase-3与GSNO的孵育诱发30 kDa TnT越来越低。在100和200 μM GSNO组相互之间都没有测试到非常明显的差异性(P > 0.05),而当GSNO的浓度值做到400 μM 时,该场面描写相关系数增多(P < 0.05)。他们发展表达了SNO淡化的caspase-3对TnT可分解的减缓力。结球核血清质和TnT是caspase-3的明感底物,而GSNO解决缩减caspase-3的特异性氧将诱发肌原纤维棉素素球核血清质可分解因素缩减。以上所论,NO诱惑的S-亚硝基化就可以使用淡化半胱氨酸残基来调整caspase-3的特异性氧,借以进一大步作用到其对结球核血清质和TnT的球核血清质溶解力,可以作用到牛肉片品级。
图6. S-亚硝基化caspase- 3生物降解肌钙核蛋白-T
二、个人总结
本探索重要途径研究S-亚硝基化对caspase-3体现的后果试述继而对羊肉片肌原食物纤维素休外生物降解的后果。蛋清S-亚硝基化就能够体现caspase-3的半胱氨酸残基,最后引致caspase-3吸附性拉低,进几步压制了其对羊肉片肌原食物纤维素蛋清的蛋清油脂水解程度。三、拜谱总结
进行分析选用了酶活测定法,亚硝基化突显组学进行分析,WB等检则具体方法,发现核淀粉酶酶质S-亚硝基化是可以突显caspase-3的半胱氨酸残基,这导至了caspase-3几丁质酶的降底,相结三步仰制了其对牛羊肉肌原纤维板核淀粉酶酶质的核淀粉酶酶质油脂水解实力。本进行分析为解说核淀粉酶酶质质亚硝基化对肉质地的调节管控体制打造了一大个新的焦距。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的核营养素组学、表达核营养素组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系类新产品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺碱化、total钝化备份、悬浮巯基,欢迎大家咨询!
决定性论文毕业论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663