
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗体阳性生物富集MHC基本结合在一起肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫性肽编码序列还有译员后绘制数据,提高基因测序的真实度,并采用De novo重头测序能力,不依赖现有数据库,挺高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且丰富多彩的数据信息了解內容为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递肿癌抗原的方式
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01 体制科研
软文便秘尴尬检查经历:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
刊发异物:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)就是种核打出蛋白酶,在肠癌中三天两头过表达方式,逐项为肿癌时有发生的驱使原因。近些年,靶点XPO1的小原子正被看做临床医学防癌用量。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫性肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 一个起源于XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 淋巴肿瘤-免疫性诊治
的文章大题目:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
先生发表月刊:Nature Communications IF:16.6 2023
恶意胸膜间皮瘤(MPM)一种效果劣质的侵蚀性癌症晚期。所以目前有的手术治疗方法方法方案格式短缺的作用,所以急切需求需求新的手术治疗方法方法对策。长期以来其T細胞侵润性,小说家统计假设MPM一个适合的手术治疗方法方法性癌症晚期防疫针的任务。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用研究背景质谱的天然免疫肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶变胸膜间皮瘤天然免疫肽组学测量
03 真菌mRNA预防针搭建
本文填空题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
公布自媒体:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过应用于质谱的免疫抗体肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌影响的Hela组织和HCT-116组织中签定MHC I呈递的抗原肽。
拜谱总结ppt
免役体团体肽组学是血清质组学的的便捷不断发展的分支节点,它专心致志于研发免役体团体程序中由包括团队相融性复合型体(MHC)或人类白体团体抗原(HLA)原子呈递的免役体团体肽。这部分免役体团体肽是体团体外表呈递的肽段,才能被T体团体自动识别,而使勾起免役体团体现象。由于质谱的免役体团体肽组学就已变成认定MHC血清呈递肽的金条件方式方法,才能进行认定区别身体和病检情况下下区别团队和体团体种类中的免役体团体肽组,举例说明实体化瘤或新冠病毒病毒性的体团体。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的球蛋白组学、新陈代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫系统肽组验测工作,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,也可以较准且直接性具备天然免疫系统肽编码序列,出现 更加多非常见天然免疫系统肽,经过层层的需求出是真的吗新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
选取医学文献
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y